Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1Q9UJ41 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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