Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms