Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms