Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms