Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms