Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms