Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms