Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms