Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SAE1Q9UBE0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms