Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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