Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms