Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms