Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms