Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RDH8Q9NYR8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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