Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms