Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1Q9H875 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms