Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms