Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms