Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms