Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms