Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTA3Q9BTC8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms