Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms