Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms