Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP88Q99567 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms