Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms