Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms