Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms