Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC9Q96Q05 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms