Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms