Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf72Q96LT7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf72Q96LT7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf72Q96LT7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf72Q96LT7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf72Q96LT7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms