Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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