Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms