Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms