Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CELF6Q96J87 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms