Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms