Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E3Q969T4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE2E3Q969T4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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