Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms