Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER1Q8TC90 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER1Q8TC90 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms