Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF397Q8NF99 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF397Q8NF99 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF397Q8NF99 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF397Q8NF99 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF397Q8NF99 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms