Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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