Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms