Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC21AQ8NDW8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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