Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APCDD1LQ8NCL9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms