Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms