Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms