Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX3Q8N9I9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms