Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms