Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLF2Q8IX21 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms