Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms