Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC4Q7Z404 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms